blast 中的ACC.Len是什么意思

关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题

ncbi主页 进入 blast 进入 nucleotide blast 将序列粘入窗口中 选择nucleotide cllection（nr/nt）选项 进行比对就可以了 出来的序列相似性最高的就是你的目的序列

blast序列比对怎么条参数，总出现No significant similarity found?

在提交比对序列的页面下部就有参数调节，一般使用默认参数即可 你这个序列可能的确是新序列吧，所以在数据库中找不到匹配的 如果是编码蛋白的基因，将其翻译成蛋白后用blastp来比对

BLAST验证后碱基序列与所输入序列不一致是怎么回事？

看起来上游引物只在5'多了3个base，下游引物5'多了3个base，也就是说向后挪了一个氨基酸。据我的经验，这两个引物应该不算有区别的=) 而且既然人家已经发出了文献，就证明这个结果是被人认可的，跟blast不同也没什么。 如果你实在不放心，不如用oligo6等软件查一下，看看哪一组的tm比较接近就用哪个。P出来的东西可以算是一样的。

VB如何实现反向互补序列，如将CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC 转换为：GTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCG

PrivateSubForm_Load()

DimAAsString

DimBAsString

A=InputBox("请输入碱基序列：","输入！")

A=UCase(A)'变成大写

Rem碱基互补配对

A=Replace(A,"C","1")

A=Replace(A,"T","2")

A=Replace(A,"G","3")

A=Replace(A,"A","4")

A=Replace(A,"1","G")

A=Replace(A,"2","A")

A=Replace(A,"3","C")

A=Replace(A,"4","T")

Rem反向

Fori=Len(A)-1To1Step-1

B=B&Mid(A,i,1)

Nexti

Rem输出

CallInputBox("反向碱基序列为：","输出反向碱基序列！",B)

End

EndSub

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复制上述代码至代码框运行看下效果吧，有问题再说.

BLAST验证后碱基序列与所输入序列不一致是怎么回事？

看起来上游引物只在5'多了3个base，下游引物5'多了3个base，也就是说向后挪了一个氨基酸。据我的经验，这两个引物应该不算有区别的=) 而且既然人家已经发出了文献，就证明这个结果是被人认可的，跟blast不同也没什么。 如果你实在不放心，不如用oligo6等软件查一下，看看哪一组的tm比较接近就用哪个。P出来的东西可以算是一样的。