为什么核酸分离后要鉴定纯度
- 教育综合
- 2022-05-26 17:43:34
为什么用OD260/OD280评定核酸纯度
核酸的最大吸收波长是260nm,这个物理特性为测定核酸溶液浓度提供了基础。
在波长260nm紫外线下,1 OD值的光密度相当于双链DNA浓度为50μg/ml;单链DNA或RNA为40μg/ml;寡核苷酸为20μg/ml。可以此来计算核酸样品的浓度。
通过测定在260nm和280nm的紫外线吸收值的比值(A260/A280)可以估计核酸的纯度。纯DNA的比值为1.8,纯RNA的比值为2.0。若DNA比值高于1.8,说明制剂中RNA尚未除尽。RNA、DNA溶液中含有酚和蛋白质将导致比值降低。样品中如混有RNA比值上升。
扩展资料
显示DNA的传统方法是富尔根(Feulgen)反应,切片先用稀盐酸处理,DNA经弱酸(1mol/L HCL)水解后,在60℃条件下使DNA分子中脱氧核糖与嘌呤之间的连接打开,脱氧核糖的一端释放出醛基,并在原位与Schiff试剂反应生成紫红色产物。
原理同PAS反应,使细胞核DNA显紫红色。在此过程中RNA不受影响,故染色具有DNA特异性。准确的温度和盐酸浓度,适宜的水解时间是成功的关键。水解过度或不足均降低染色强度。
核酸可分为脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)和核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)。
核酸不但是一切生物细胞的基本成分,还对生物体的生长、发育、繁殖、遗传及变异等重大生命现象起主宰作用。它在生物科学的地位,可用“没有核酸就没有生命”这句话来概括。
参考资料来源:百度百科-核酸
参考资料来源:百度百科-核酸显示法
参考资料来源:百度百科-OD260/280比值
酵母核糖核酸的分离和鉴定。实验原理
一、 实验目的
1、掌握酵母RNA提取的方法。
2、了解核酸的组成。
3、掌握鉴定核酸组分的方法和操作。
二、 实验原理
酵母核酸中RNA含量较多,DNA则少于2%。RNA可溶于碱性溶液,当碱被中和后,可加乙醇使其沉淀,由此即可得到RNA制品。但是用碱液提取的RNA有不同的降解。RNA含有核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸等组分,加入硫酸煮沸可使其水解,从水解液中可以测出上述组分的存在(见实验内容)
三、 实验步骤
1、 用托盘天平称1g干酵母于研钵中,加入少许石英砂,再加入2ml 0.04mol/LNaOH溶液,在研钵中充分研磨至少5min。
2、 再加4ml 0.04mol/LNaOH溶液于匀浆液中,混匀后,将匀浆液转移到大试管中,再用4ml 0.04mol/LNaOH溶液洗涤研钵,洗涤液并入匀浆液中。
3、 将大试管小心在沸水浴中加热30min,冷却后倒入离心管中,与另一组同学的离心管在托盘天平上平衡,然后两组的离心管对称地放入离心机中,2000r/min下离心15min。
4、 吸取10ml酸性乙醇溶液于小烧杯中,将离心管上清液小心倒入小烧杯中,边倒入边搅拌,直到RNA沉淀完全。
5、 将小烧杯中的液体倒入2个干净的离心管,平衡、离心(2000r/min)3min。
6、 弃去两离心管上清液,各离心管中加入95%乙醇2.5ml,振荡、混匀、平衡、离心(2000r/min)3min。
7、 弃去两离心管上清液,各离心管加入3ml 1.5mol/L硫酸,混匀、倒入同一个大试管中,贴上标签,放在试管架上,备用。
8、 将水解液在沸水浴中加热至少10min,使沉淀RNA充分水解。
9、 取一支试管A,加入1ml 0.1mol/L硝酸银溶液,再逐滴加入浓氨水至沉淀消失,然后加入1ml水解液放置片刻,观察有无白色嘌呤碱的银化合物沉淀。
10、 另取一支试管B,加入水解液1ml,三氯化铁浓盐酸溶液2ml和地衣酚乙醇溶液0.2ml(约4滴),混匀,用试管夹夹好后放到沸水浴中3~5min,注意观察溶液是否变成绿色,说明核糖的存在。
11、 再取一支试管C,加入水解液1ml和定磷试剂1ml,混匀,在沸水浴中加热,注意观察溶液颜色的变化,溶液变蓝,说明磷酸存在。
注意事项:离心一定要平衡对称放入离心机中,离心机达到设置转速时才能离开。
四、 实验结果
第6步中离心管底部有不少的RNA沉淀。
试管A:出现白色浑浊现象。有嘌呤碱存在。
试管B:加热后,出现鲜绿色,且随着加热时间延长,颜色越来越深。有核糖存在。
试管C:加热后,出现蓝色,且随着加热时间延长,颜色越来越深。有磷酸存在。
说明RNA的组分中有嘌呤碱、核糖、磷酸。
分析:
本实验选用酵母,是因为酵母中RNA含量较多,且价格便宜。RNA可溶于碱性溶液,所以本实验用0.04mol/LNaOH溶液来提取。RNA不溶于乙醇,可用酸性乙醇使RNA从溶液中沉淀出来,再用乙醇洗涤沉淀,可得到RNA粗制品。
研磨和NaOH使酵母细胞破裂,RNA主要存在于细胞质中,所以RNA被释放出来,同时,NaOH使蛋白质变性。
加入酸性乙醇,一方面可以中和NaOH,另一方面,使RNA从溶液中沉淀下来。
RNA含有核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸等组分,加入硫酸煮沸可使其水解,从水解液中可以测出上述组分的存在。
(1)、强酸使核酸分子的有机磷消化为无机磷,使之与钼酸铵结合成磷钼酸铵(黄色沉淀)
PO43- + 3NH4+ + 12MoO42- + 24H+ ===(NH4)3PO4.12MoO3.6H2O + 6H2O
当有还原剂(如维生素C)存在时,Mo6+被还原成Mo4+,再与试剂中的其它MoO42-结合成Mo(MoO4)2,呈蓝色,称钼蓝。所以试管C中会出现蓝色。
(2)、RNA与硫酸共热,生成的核糖进而脱水转化为糠醛,三氯化铁作为催化剂,可与地衣酚反应,生成绿色化合物,所以试管B中出现绿色。(OR苔黑酚)
(3)、嘌呤碱可与硝酸银反应产生白色的飘零银化合物沉淀。所以试管A中出现浑浊现象。
(4)、不检测嘧啶碱,是因为与嘌呤碱相比,它难以被水解下来,同时它难检测且现象不明显。
扩展资料:
酵母核酸提取原理
提取和制备RNA 的首要问题是选RNA 含量高的材料。微生物是工业上大量生产核酸的原料,其中RNA 的提制以酵母最为理想,因为酵母核酸中主要是RNA(2.67~10.0%),DNA 很少(0.03~0.516%),而且菌体容易收集,RNA 也易于分离。
RNA 提制过程首先要使RNA 从细胞中释放,并使它和蛋白质分离,然后将菌体除去。再根据核酸在等电点时溶解度最小的性质,将pH 调至2.0~2.5,使RNA 沉淀,进行离心收集。然后运用RNA 不溶于有机溶剂乙醇的特性,以乙醇洗涤RNA 沉淀。
提取RNA 的方法很多,在工业生产上常用的是稀碱法和浓盐法。浓盐法是在加热的条件下,利用高浓度的盐改变细胞膜的透性,使RNA 释放出来,此法易掌握,产品颜色较好。
使用浓盐法提出RNA 时应注意掌握温度,避免在20~70℃之间停留时间过长,因为这是磷酸二酯酶和磷酸单酯酶作用的温度范围,会使RNA 因降解而降低提取率。在90~100℃条件下加热可使蛋白质变性,破坏磷酸二酯酶和磷酸单酯酶,有利于RNA 的提取。
参考资料:百度百科—酵母核酸
核酸分离提取的原则是什么?
核酸分离提取的原则 核酸包括DNA、RNA两种分子,在细胞中都是以与蛋白质结合的状态存在。真核生物的染色体DNA为双链线性分子,原核生物的“染色体”、质粒及真核细胞器DNA为双链环状分子;有些嗜菌体DNA有时为单链环状分子,RNA分子在大多数生物体内均是单链线性分子,不同类型的RNA分子可以具有不同的结构特点,如真核mRNA分子多数在3’端带有poly(A)结构,至于病毒的DNA、RNA分子,其存在形式多种多样,有双链环状、单链环状、双链线状及单链线状等。 95%的真核生物DNA主要存在于细胞核内,其它5%为细胞器DNA,如线粒体、叶绿体等。RNA分子则主要存在于细胞质中,约占75%,另有10如何判断提取质粒DNA的纯度
可以通过紫外吸收检测。
因为核酸的最大吸收波长为260nm,蛋白质为280nm,在波长260nm时,1OD值相当于双链DNA浓度为50μg/ml,单链寡核苷酸的含量为30μg/ml,可以据此来计算核酸样品的浓度,还可通过测定在260nm和280nm得OD值的比值,估计核酸的纯度。
纯净DNA的比值为1.8, RNA为2.0。若比值高于1.8说明DNA样品中的RNA尚未除尽,若样品中含有酚和蛋白质将导致比值降低。
270nm存在高吸收表明有酚的干扰。 紫外分光光度法只能用于测定浓度大于0.25μg/ml的核酸溶液,对浓度更小的样品,可采用荧光分光光度法。
扩展资料:
在判断过程中,也有可能出现质粒DNA提取纯度失败的情况,具体可能是有以下几个原因:
1、菌体量可能过大,裂解不充分,或裂解液与中和液比例不适当;
2、混合时过于剧烈,可能会带来基因组DNA片段的污染;
3、Rnase失活,可能带来RNA污染;
4、离心不充分(有絮状物在上层),或在离心后吸取上清时,将沉淀吸入,会带来蛋白质污染.
参考资料来源:百度百科——质粒DNA纯化
核酸在分离与纯化 时,需要用那些物质?其作用是什么?
1 加入浓盐溶液(如NaCl) 核酸-蛋白质加入NaCl后,破坏静电吸力,使氢键破坏,核蛋白解聚; 2 加入SDS SDS除有破胞和抑制核酸酶的作用外,还具有使核酸从蛋白质上游离出来的功能; 3 酚/氯仿抽提 酚/氯仿混合使用能增加去除蛋白的效果,并对核酸酶有抑制作用。 氯仿比重大,能加速有机相与水相分层,减少残留在水相中的酚,同时氯仿具有去除植物色素和蔗糖的作用。 在酚/氯仿抽提核酸提取液时,需要振摇,为防止起泡和促使水相与有机相的分离,再加上一定量的异戊醇(酚:氯:异戊醉=25:24:1)。下一篇
宁可不干、也要不犯是什么意思