ncbi基因所处的基因组位置怎么查看
- 教育综合
- 2023-07-05 07:57:16
求教怎么看NCBI的基因图
NC表示人类基因组DNA的RefSeq。(链接序列) NM表示mRNA的RefSeq。 NP表示蛋白质的RefSeq 查找基因的基本信息的方法如下: 根据文献中已知的基因ID如果你在文献中看到你感兴趣的基因,而且文中还提到了 基因在Genbank中的ID号,那就好办了,直接打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov ,在Search后的下拉框中选择Nucleotide,把Genbank ID号输入GO前面的文本框中,点“GO”,就可以找到了。(如GenBank accession number gi 16151096)”。 2. 根据已经获得的基因的相关信息进行查找,打开htt怎么从NCBI上查某个基因序列?
1、打开NCBI
百度搜索键入“NCBI”,点击“搜索”,第一个就是官方主页,点击打开。
2、关键字查找
以H9亚型流感病毒HA基因下载为例,说明详细过程。
既然要下载基因序列,需要在栏目内找到“Nucleotide”(核苷酸),搜索栏内填入“Avian influenza virus H9 HA”,点击“search”。
3、添加限定词
点击搜索后,我们看到页面中间显示了很多关于“Avian influenza virus H9 HA”的基因序列,如果其中的一个符合你的要求,就可以下载。
如何不符合的要求,可以继续在搜索条内添加限定,比如添加“2010”,即2010年分离到的病毒。
3、序列选定
找到目标基因序列后,我们要将其下载下来。以给出第一个序列为例,点击序列前面的“小方格”,将其选定。
4、下载序列
选定后,点击页面右上角的“Send to”,选择“file”,再将format选择为“FASTA”格式,点击“Create file”,将序列下载到自定的文件夹内。
5、用DNAStar打开
下载的序列为FASTA格式,需要使用相关的软件打开,小编经常使用的是DNAStar中的Editseq,这个功能还是很强大的。
怎样在NCBI中查找基因
找几个近源的物种的该基因clustal,找出几个长度大于20的保守区,在这几个保守区域拉几条引物,放到primer5里评一下分,找一对分数高的引物,产物长度200-1000bp都可以,扩去就行了。如果找不到完全一致的引物,就在不一样的那个碱基上设计成简并的。 如果知道要找的基因的名字是可以很快的找到要找的序列,在基因名称检索界面输入就好。 因为提交NCBI上的基因组都有预测CDS的,上面都标出每个CDS的可能功能及相应蛋白或酶的名字 如果不知道基因名字,可以通过做比对来判断,可以尝试一下用BIOED如何在NCBI上查找某个基因在染色体的位置,例如显示出在第几号染色体。。基因序列什么的都清楚,就是不...
在NCBI网站,选择OMIM(PUBMED下面),输入基因名称,你会获得许多关于该基因的信息,其中就包括染色体定位。怎么在ncbi查找犬类的全基因组
网页链接
在ncbi页面搜索,左边选择genome, 右边输入你的物种名,搜索,会出现一个页面,上面显示相关物种的进化树,点开你需要的物种名,出现相关信息,点击其在ncbi的序列号,就可以看到基因组信息了,前提是有这个物种的全基因组信息。
详细如下图
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求大佬帮忙,在线等,感激不尽
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