真菌测序的通用引物its1和its4序列、its4和its5有什么区别

内生真菌分子鉴定，its1 its4引物序列

可以用ITS1跟4，这个引物是通用引物，你在生工或者其他公司合成时对方应该是有现货的，不提供序列也可以的。如果实在需要，在网上随便查查吧，挺容易找到的。条件设置就按照常规的就行，这对引物还是很皮实的，一般都能扩出来，开始可以试一下95 3min，95 30s，55 40s，72 1min，72 10min，再根据具体情况稍微微调一下就行。你做内生菌建议你用ITS1f-ITS4f引物对，就是真菌特异ITS1-4引物对，可能效果更好一些，能一定程度上排除宿主本身DNA的干扰。

酵母DNA 用 ITS1和ITS4 引物， PCR扩增产物有多大。扩增基因序列怎么找？

1.不同真菌的ITS片段大小是不一样的，大小在500-750bp之间，个别在1000左右 2.土壤样品的DNA提取物用ITS1和ITS4这对引物扩增在500-750bp大都有2个目标条带是正常的，因为土壤中的真菌种类很多，所以条带会多，而且普通电泳无法区分，所以用切胶回收做克隆测序的话，也会得到很多真菌，而不是单一的，我觉得做克隆测序是可以的

ITS鉴定的真核生物核糖体RNA（rRNA）结构

组成真核生物核糖体RNA( rRNA) 有5 、5 .8 、17 ～18( 以下统称为18 S) 和25 ～28 S( 以下统称为28 S) 。对于大多数真核生物来说, 核糖体rRNA 基因群的一个重复单位( rDNA) 包括以下区段( 按5′→3′方向) : ①非转录区( Non Transcribed Sequence), 简称NTS ; ②外转录间隔区( External Transcribed Spacer), 简称ETS ; ③18 S rRNA 基因, 简称18 SrDNA ; ④内转录间隔区1( Internal Transcribed Spacer 1) , 简称ITS1 ; ⑤5 .8 S rRNA基因, 简称5 .8 SrDNA; ⑥内转录间隔区2 , 简称ITS2 ; ⑦28 SrRNA 基因, 简称28 S rDNA。ITS1 和ITS2 常被合称为ITS, 并且5 .8 S RNA 基因也被包括在ITS 之内。核糖体内转录间隔区包含2 个不同的非编码区域, 即ITS1 和ITS4 。ITS 序列在物种属内、近缘属间乃至科内系统进化关系研究中有一定的价值。真菌核糖体基因由小的亚单元( 18 S) 、ITS1 区、5 .8 S 区、ITS2 区和大的亚单元( 28 S) 构成, 头尾串联形成重复序列, 一个基因组内有60 ～200个拷贝。

什么是ITS1和ITS4

这对引物主要是扩增its区的，18s的的最后一部分及28s开头的一部分也会扩增，但只有几十个bp 5.8s倒是完全包括在内

真菌能做菌落pcr吗

真菌能做菌落pcr 这个是因为大肠杆菌是杆菌属于原核生物（细胞壁是由肽聚糖组成的细胞壁，且没有细胞核），很容易破裂而且在做PCR的时加的缓冲液下破裂后遗传物质就出来了就可以做模板了（但是浓度不高 所以在做菌落PCR时加的模板就比较多），而酵母菌是真核生物（有含甲壳素为主要成分的细胞壁，且有细胞核），酵母比较难破，就算破了 遗传物质还在细胞核中，，所以真菌是不可以菌落PCR的。。纯手打！